La Academia ESPOL abrió sus actividades en el Campus Gustavo Galindo a fines del año 2001, operando inicialmente en los laboratorios de la FIEC, y posteriormente en los laboratorios del CIB. Inicialmente funcionó como una academia local en el Ecuador, bajo la Academia Regional de la Universidad San Francisco de Quito. En el año 2002 abrió actividades en el campus Peñas, en los laboratorios de la LSI, y en el año 2003, la Región CANSAC de Cisco Networking Academy, le otorgó el aval como Academia Regional en el Ecuador.

En el año 2005 se crean los primeros convenios con otras Universidades, en los que aparecieron la Universidad Politécnica Salesiana con sus 3 sedes (Guayaquil, Quito y Cuenca), y posteriormente se unieron la Escuela Superior Politécnica del Chimborazo, la Universidad Nacional de Loja, Universidad Técnica Estatal de Quevedo, Universidad técnica de Machala, Universidad de Especialidades Espíritu Santo, Universidad Estatal de Guayaquil, Universidad Católica de Guayaquil, Universidad Nacional del Chimborazo, Universidad Central del Ecuador, Pontificia Universidad Católica del Ecuador, Universidad Tecnológica América, PUCE Sede Ibarra, Universidad Técnica de Ambato, Universidad de Bolívar, Universidad Técnica del Norte, entre otras. De esta forma la ESPOL llega a convertirse en la principal academia Regional del Ecuador y una de las más importantes de la región CANSAC de Cisco. Ha sido nombrada dos veces la mejor academia de la región.